Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTP4A2Q12974 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms