Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms