Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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HOXD1Q9GZZ0 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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HOXD1Q9GZZ0 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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HOXD1Q9GZZ0 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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