Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NRF1Q16656 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms