Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms