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| BRD3 | Q15059 | AC015540.1-201 | ENST00000615828 | 501 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
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| BRD3 | Q15059 | U6.42-201 | ENST00000618440 | 107 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC093536.2-201 | ENST00000565257 | 1406 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | CCDC82-201 | ENST00000278520 | 2941 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | AGL-206 | ENST00000370165 | 7106 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | MBNL1-223 | ENST00000498502 | 5258 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | SHOC2-201 | ENST00000265277 | 3691 nt | TSL 2 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00305-201 | ENST00000323355 | 873 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | RAB9AP3-201 | ENST00000412737 | 573 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | GPC5-AS1-201 | ENST00000419288 | 393 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL589986.2-201 | ENST00000429352 | 397 nt | TSL 2 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | RAB9AP1-201 | ENST00000449393 | 573 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | NDUFB1P2-201 | ENST00000449477 | 176 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC087241.4-201 | ENST00000612441 | 480 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC244517.5-202 | ENST00000623741 | 500 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | MAP3K7-202 | ENST00000369325 | 4633 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | Z83843.1-201 | ENST00000604070 | 3685 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | FAM35CP-201 | ENST00000554755 | 2470 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | CBLL1-201 | ENST00000222597 | 2003 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF85-203 | ENST00000345030 | 1689 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC138915.1-201 | ENST00000565427 | 1685 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | ATP2B1-203 | ENST00000393164 | 3127 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | ROCK2-203 | ENST00000401753 | 4017 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | DEFB107A-201 | ENST00000335021 | 389 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | DEFB107B-201 | ENST00000355602 | 389 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORD14B-201 | ENST00000364533 | 90 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA51.4-201 | ENST00000364993 | 124 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | DYNLT3P1-201 | ENST00000378574 | 347 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR5H8-201 | ENST00000394191 | 1045 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL592148.1-201 | ENST00000413568 | 445 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL627311.1-201 | ENST00000431514 | 115 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | OSTCP8-201 | ENST00000445117 | 448 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL23AP20-201 | ENST00000447965 | 421 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | NIPA2P5-201 | ENST00000452282 | 464 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC027673.1-201 | ENST00000456245 | 405 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA70.18-201 | ENST00000516696 | 98 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP005435.4-201 | ENST00000529514 | 284 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR5B10P-201 | ENST00000532869 | 642 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP003034.1-201 | ENST00000534621 | 422 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC027288.1-203 | ENST00000552167 | 567 nt | TSL 4 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092120.1-201 | ENST00000562211 | 420 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTATP6P3-201 | ENST00000581686 | 676 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4458HG-202 | ENST00000605918 | 1057 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |