Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CACNA1CQ13936 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
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