Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
APOFQ13790 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
APOFQ13790 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
APOFQ13790 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
APOFQ13790 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
APOFQ13790 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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APOFQ13790 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
APOFQ13790 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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