Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ACACAQ13085 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ACACAQ13085 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ACACAQ13085 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ACACAQ13085 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ACACAQ13085 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ACACAQ13085 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ACACAQ13085 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ACACAQ13085 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ACACAQ13085 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms