Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TTPAP49638 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
TTPAP49638 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
TTPAP49638 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
TTPAP49638 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TTPAP49638 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms