Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPFP49454 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPFP49454 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPFP49454 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPFP49454 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CENPFP49454 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPFP49454 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPFP49454 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPFP49454 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CENPFP49454 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CENPFP49454 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CENPFP49454 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms