Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SAMD8Q96LT4 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SAMD8Q96LT4 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms