Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
C9orf135Q5VTT2 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms