Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PXDC1Q5TGL8 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.2 ms