Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ZNF239Q16600 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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