Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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