Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RFTN1Q14699 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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RFTN1Q14699 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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RFTN1Q14699 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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RFTN1Q14699 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RFTN1Q14699 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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