Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1Q13813 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
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