Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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TOP3AQ13472 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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TOP3AQ13472 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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TOP3AQ13472 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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TOP3AQ13472 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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TOP3AQ13472 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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TOP3AQ13472 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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TOP3AQ13472 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TOP3AQ13472 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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