Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLN3Q13286 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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