Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms