Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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