Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GRIK3Q13003 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK3Q13003 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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