Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SH3BP4Q9P0V3 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SH3BP4Q9P0V3 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SH3BP4Q9P0V3 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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SH3BP4Q9P0V3 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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