Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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