Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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