Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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GRIK5Q16478 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK5Q16478 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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