Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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SCN9AQ15858 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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SCN9AQ15858 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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SCN9AQ15858 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
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SCN9AQ15858 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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SCN9AQ15858 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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SCN9AQ15858 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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SCN9AQ15858 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN9AQ15858 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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