Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHHQ15465 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHHQ15465 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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