Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.5 ms