Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SF3B2Q13435 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms