Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms