Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NFIAQ12857 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms