Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SNX13Q9Y5W8 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNX13Q9Y5W8 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNX13Q9Y5W8 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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