Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CDKN3Q16667 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CDKN3Q16667 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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