Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNAPC1Q16533 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms