Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms