Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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ALX1Q15699 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ALX1Q15699 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ALX1Q15699 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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