Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PCOLCEQ15113 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms