Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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PDE6HQ13956 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PDE6HQ13956 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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