Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
NAE1Q13564 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms