Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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