Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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CHAF1AQ13111 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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