Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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