Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms