Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms