Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
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