Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms