Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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