Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FAM3DQ96BQ1 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms