Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TMIEQ8NEW7 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms